Остаточные (остатки прошлых морских бассейнов - Каспийское море, Аральское море), тектонические (обусловленные разломами в земной коре - Байкал, Таньгаика, Балхаш, Севан), вулканические (в кратерах потухших вулканов - Курильские озера на Камчатке), ледниковые (котловины Вспаханные давним ледником - Бребенескул и душераздирающее в Карпатах, Ладожское, Онежское), пойменные (образованные в долинах рек - Ялпуг, Кагул, Кугурлуй), лиманные (отделены от моря косой или насыпью - Сасык), Загатни (заграждения горных рек рухнувшими горными породами - Синевир, Сарезское в Памире), карстовые (местность состоит из легкорастворимых пород - Швейные озера), старицы (участок русла реки, изменила направление).
Значительному загрязнению подвергаются воды морей и океанов. С речным стоком, а также от морского транспорта в моря поступают вредные отходы, нефтепродукты, соли тяжёлых металлов, ядовитые органические соединения, в том числе пестициды. Загрязнение морей и океанов достигает таких масштабов, что в ряде случаев выловленные рыбы и моллюски оказываются непригодными для употребления в пищу. Пестициды (от лат. пестис – зараза и цедере – убивать), используемые в сельском хозяйстве для борьбы с насекомыми-вредителями, обнаружены даже в организме пингвинов, обитающих в Антарктиде.