Вкаких падежах стоят всё имена существительные в предложение : я тоже нашёл глазами бумажный кораблик,который едва виднелся на воде.

Кораблик-именительный падеж

Нашел (чем?) глазами - Творительный Падеж
нашел (что?) кораблик - винительный падеж
виднелся (на чем?) - предложный