В последние годы в стране все больше внимания уделяется водноэкологическим проблемам, укреплению водоохранных органов, на которые возлагается обязанность по организации контроля за состоянием водной среды, предотвращению и устранению последствий загрязнения и истощения вод. В бассейне Ангары главными рабочими и координирующими органами являются Иркутский областной и Красноярский краевой комитеты по охране окружающей среды и природных ресурсов. В их функции входит комплексное управление охраной вод и государственный контроль за их использованием, экологическая экспертиза проектных решений по строительству новых объектов, реконструкции и расширению действующих, выдача разрешений на сбросы загрязняющих веществ в водные объекты и использование водных ресурсов, ограничение или приостановление деятельности предприятий, нарушающих водоохранное законодательство, предъявление исков о возмещении вреда, причиненного водным объектам, обеспечение населения экологической информацией.Животный и растительный мир Ангары, сложился под влиянием Байкала. В верхнем и среднем течении реки присутствует множество видов животных распространненых в озере. С недавних пор в реке появилсябайкальский омуль, а также, совсем экзотическая рыба для местных рек - радужная форель.