Не противоречит ли закону сохранения массы веществ тот факт, что масса горящей свечи со временем уменьшается

Не противоречит.
Свеча горит, значит органическое соединение парафин или воск (смотря из чего сделана свеча) соединяется с кислородом. В результате образуются газы: углекислый газ и вода (пар). Одни вещества превращаются в другие:
Парафин (воск...) + О2 СО2 + Н2О