Первоначально хутор именовался Понура, как и рядом протекающая река. А в 1919 году, по воле хуторян, к его названию прибавили фамилию батрака Семена Антоновича Бойко, погибшего в борьбе с корниловцами, и он стал называться Бойко-Понура. В дальнейшем хутор стал назаваться Бойкопонура.