Межпластовые воды находятся между двумя водоупорными слоями. Межпластовые воды могут быть напорными и безнапорными. Межпластовые воды защищены на значительное время от загрязнений.Характерной особенностью межпластовых вод является отсутствие в них растворенного кислорода. Тем не менее микробиологические процессы оказывают существенное влияние на их состав.