Можно использовать анаэробные бактерии, которые субстратом (пищей) считают вышеперечисленные вещества. Или нейтрализовать данные вещества путем добавления в почву разных химических элементов или растворов. К примеру мышьяк нейтрализируется хлорированием. А вообще, надо просто дать почве передохнуть.