Длительное применение минеральных удобрений привело к росту кислотности наиболее распространенных в Нечерноземье дерново-подзолистых почв. Миллионные вложения в мелиорацию не дают ощутимых результатов, а в ряде мест (например, в Мещере) мелиорация привела к нарушению водного режима почв, быстрой минерализации торфа, уменьшению почвенного плодородия. Понижение грунтовых вод в результате мелиорации отрицательно сказалось на состоянии лесов, прилегающих к осушенным территориям. На осушенных территориях снизилась урожайность зерновых и картофеля. Наряду с заметным (в 4 раза) сокращением площадей, занятых под культуру льна-долгунца, и урожайности этой культуры, имели место серьезные нарушения экологических требований в льноводстве