По характеру воздействия на организм мутации делят на летальные, полулетальные, нейтральные и полезные. Из них летальные и полулетальные приводят к смерти организма или к ухудшению каких-либо процессов жизнедеятельности, что может вызвать гибель. Нейтральные мутации никак не проявляются и не влияют на фенотип организма. И только полезные мутации могут проявляться в фенотипе.