Половая система червей гермафродитная, повторяется в каждом членике. У видов с нерасчлененным телом может быть одиночный половой аппарат или метамерный ряд половых аппаратов. У цестод небольших размеров оплодотворение перекрёстное. Крупные формы (солитеры) встречаются в кишечнике хозяина поодиночке, что делает перекрёстное оплодотворение невозможным. При половом размножении у них происходит копуляция разных члеников одной особи. Самооплодотворение в пределах одного членика очень редко
в ограниченном пространстве организма хозяина не особо разгуляешься в поисках полового партнера, особенно, когда в него с трудом попал после скитания по промежуточным. Поэтому, приходится довольствоваться самоудовлетворением ради продолжения рода.