Кожна мітохондрія оточена оболонкою, що складається з двох мембран. Зовнішню мембрану відокремлює від внутрішньої невелику відстань - внутрімембранное простір. Внутрішня мембрана утворює численні гребневидние складки, так звані Крісті. Крісти істотно збільшують поверхню внутрішньої мембрани, забезпечуючи місце для розміщення компонентів дихального ланцюга. Через внутрішню мітохондрій-ально мембрану здійснюється активний транспорт АДФ і АТФ. Метод негативного контрастування, при якому забарвленими виявляються не самі структури, а простір навколо них, дозволив вияоіть присутність особливих «елементарних частинок» на тій стороні внутрішньої мітохондріальної мембрани, яка звернена до матриксу. Кожна така частинка складається з головки, ніжки і підстави.