В точках ветвления мономеры соединены а-1,6-гликозидными связями. Эти связи образуются примерно с к десятым остатком глюкозы. Точки ветвления гликогена встречаются через каждые десять остатков. Таким образом, в молекуле гликогена имеется только одна свободная аномерная ОН-группа и только один восстанавливающийся конец.